严佳文¹ , 解璞¹ , 袁启凤¹ , 马玉华^1* , 廖仕琴²

1贵州省农业科学院果树科学研究所,贵阳, 550006; 2罗甸县果业产业化发展办公室,罗甸, 550100
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2019年10月30日    接受日期: 2018年11月02日    发表日期: 2021年01月21日

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西番莲是中国南方地区重要的热带水果，富含多种生物活性成分，具有较高的开发价值。本研究对‘紫香1号’西番莲进行了基因组调查测序，测序深度为134.52×，获得高质量数据200.94 Gb。基于K-mer分析，预测基因组大小约为1 501 Mb，重复序列含量为76.11%，杂合度0.003%，GC含量42.82%。此外，在拼接的基因组序列中鉴定了202 272个SSR位点，其中含有单核苷酸重复基元的SSR位点有123 672个，占SSR总数的61.14%，其次是含有二核苷酸重复基元的SSR(53 951, 26.67%)和含有三核苷酸重复基元的SSR(18 712, 9.25%)。本研究为西番莲全基因组测序策略确定和SSR分子标记开发提供了理论依据和参考。

西番莲(Passiflora edulis)；基因组；SSR